Y染色体微缺失在严重的少弱精子症男性同志中比较常见，占比约为10%，其致病原因如下：

1、遗传因素，存在Y染色体微缺失的男性患者，其父亲可能也存在Y染色体微缺失。Y染色体微缺失可以导致严重的少弱精子症，但是部分弱精或者少精患者，也有一定的生育机会，所以少部分患者可能是从父亲遗传而来；

2、突变造成Y染色体微缺失，即在胚胎发育早期，母亲怀孕前两个月时由于受到外界某种因素，比如物理、化学、生物、药物或者射线等因素影响，Y染色体发生突变，导致Y染色体微缺失。