扁桃体结石是慢性扁桃体炎的一个表现，部分慢性扁桃体炎患者的扁桃体表面附着颗粒状较坚硬的结石，有时可通过剥脱的办法将扁桃体结石从扁桃体表面剥下，下方的扁桃体腺窝通常不会随着剥脱扁桃体结石而增大。

但部分患者由于扁桃体结石及慢性扁桃体炎的反复发作，扁桃体逐渐肿胀、增生，扁桃体腺窝逐渐加深，腺窝可能增大，扁桃体表面形成的结石也会逐渐增大。但此种腺窝的增大与处理结石无直接因果关系，因此扁桃体发生结石时，可通过剥脱或含漱等方法进行清理。