肛瘘手术后，肛门部创口在排便过程中会产生不同程度的疼痛。排便后，因为肛瘘手术创面内的粪便污染物刺激会导致内括约肌的痉挛，部分患者可能会发生持续性的疼痛。最有效、最简单的办法是使用温水坐浴的方法清洗创口，将肛瘘创面内的粪便污染物冲洗干净，温热水的敷贴作用也会使疼痛得到一定的缓解。

如果温水坐浴无明显效果，可以使用一些外用药物，如最常见的痔疮膏，具有解热镇痛的作用。此外，临床上还有一些治疗疼痛的软膏也可以缓解疼痛，包括硝酸甘油、利多卡因凝胶。也可以借助中药浸泡的方法，如止痛如神汤，止痛效果非常快速。因此，通过药液的浸泡和清洗的方法，可以有效缓解肛瘘术后大便疼痛。