小脑扁桃体下疝位置过低，对相应的脑干和脊髓构成压迫，可引起一系列功能障碍：
1.枕骨大孔区长期受压，引起脊髓空洞，患者出现肢体感觉功能障碍；
2.脑干受压，可引起患者吞咽困难，饮水呛咳等；
3.年龄较小就出现相应的症状，反映小脑扁桃体下疝畸形的程度比较严重。