常见轻的并发症称为远期慢性疼痛，大部分在3个月之内基本上完全消失。最长的病人是到半年，是长的非常壮的战士小伙子，手术解剖非常清晰，但是术后非常疼痛。到大概五个多月，复诊时痊愈。
还有些问题，比如做完手术以后大出血，可能特殊血管，做开放的腹膜前，尤其是腔镜的腹膜前手术，特殊解剖，闭孔血管，尤其是闭孔动脉死亡冠的大出血，在术中没有发现，术后1-2天大出血，术后1周以后延迟性出血，这种情况发生非常少见，但是发生后，如果不立即二次手术可致命。
其他并发症比如少见的睾丸萎缩，斜疝的疝囊靠输精管最近，其次精索血管，如果有精索血管的损伤会导致睾丸萎缩，比较少见，是睾丸萎缩的问题。还有医生自己一定要小心，尤其对于在生育期的男性，不管做开放手术还是腔镜手术，绝对不能夹持输精管，输精管一定要保护好，肯定不能横断，一定要注意细节，不能用钳子夹输精管，只能夹旁边的组织，尤其对于生育期的男性会导致不育。如果双侧操作都非常粗糙，这样可能引起一定的不孕，单侧意义不大，尤其是双侧疝手术，不管是开放还是腔镜，不育率比普通人要稍微高。
还有各种的并发症都很多，最常见的是慢性疼痛。巨大阴囊疝做完后有血清肿，也有很多避免的措施，比如放引流条、引流管。有时候也很难避免有些人疝囊，像小西瓜一样，或者像大桃子、梨一样大，术后发生血清肿可能性比较大。这种情况术后大概到半月血清肿稳定后，可能会消失，也可能做1-2次，最多3次穿刺放液也可痊愈，临床经验来讲，这些都在可控范围。