妥布霉素是儿童较常用的消炎眼药水，儿童可使用的消炎药水并不多，常用药水有妥布霉素、左氧氟沙星，也可以使用金霉素、红霉素、夫西地酸滴眼液等。妥布霉素无法全身用药，研究认为全身用药时会有一定程度的渗透性，但一切离开剂量，谈毒性都不合适、不合理。

妥布霉素的用法是滴在眼球表面，而且进入全身的药效微乎其微，滴在眼球表面的药水其实对全身无法产生较大影响。因此临床上妥布霉素是最常用的消炎药水，尤其适合新生儿。通常扒开下眼窝，将消炎药水滴入下眼眯缝里。滴眼液主要在白天使用，操作较方便，但随着眨眼，药水可较快流出。因此通常是白天滴眼药水，睡觉时涂眼膏，药店和医院有专门的妥布霉素类眼膏。