畸形精子会影响生育，与不孕和流产都有密切关系。小头精子症患者，无法自然怀孕，试管婴儿成功率也较低，基因分析会发现和基因缺陷有关。因此，精子的活力、密度、畸形率以及精子DNA碎片率与生育都有关系。如果畸形率和精子DNA碎片率高的患者，建议先治疗再怀孕，降低流产风险。