母乳生理性腹泻是因为母乳中前列腺素E2含量高所引起，前列腺素可以促进胃肠蠕动，影响水电解质代谢，引起腹泻。婴儿的胃肠功能还没有完全成熟，或者是过敏性体质，可以引起腹泻。

母乳生理性腹泻多见于6个月之内母乳喂养的婴儿，外表比较虚胖，常常会有湿疹，出生不久纯母乳喂养可出现稀水样便，有奶瓣或者少量黏液，大便有酸味，但是没有臭味，每天大便7-8次，而且大便不成形，但并无其它不适，所以婴儿不会发生哭闹，也没有血便的情况。婴儿的精神、反应、进食、体重都正常，不会造成特殊影响，所以一般不需要治疗母乳生理性腹泻。