上颌窦囊肿可引起头疼。上颌窦囊肿多发生在上颌窦的底壁以及内壁，如果囊肿很小，则病人没有任何症状。如果囊肿局限性增大，对上颌窦底及内壁压力越来越大，病人会出现面部压迫感，继而头部钝痛，同时伴有上列牙疼痛。

囊肿较小患者可以先观察，暂时不进行特殊处理。当囊肿长到一定程度，自行破裂黏液流出，继而出现鼻塞、鼻腔间断性流脓水和流清鼻涕等症状，出现这种情况时，建议早期手术治疗。