肛瘘是的发病原因包括：

1、感染：肛门裂反复感染可并发皮下瘘；

2、肛周脓肿：肛周脓肿自行溃破或切开引流后造成；

3、年龄因素：小儿、青壮年易患肛瘘；

4、物理因素：外伤导致的肛瘘；

5、医源性因素：会阴部手术或直肠手术，也可以导致肛瘘的发生。