大部分卵巢囊肿并不影响女性生育，如果卵巢囊肿需要手术治疗，医生也会尽量保护患者的卵巢功能及生育功能，不会因为手术本身，对生育功能造成严重的影响。所以卵巢囊肿会不会影响生育，根据肿物的性质和选择治疗的时机，不同的病情，各有异差。例如子宫内膜异位囊肿，无论手术与否，都有可能造成患者的不孕，但通过治疗和随访，能有效的保护患者的生育功能。