胆结石的疼痛部位由结石所在位置而定。胆囊结石多表现为右上腹隐痛，急性发作时右上腹或肝区剧烈绞痛，引起胆囊结石合并急性胆囊炎。

肝外胆管结石多表现为中上腹或中上腹偏右的疼痛，或餐后明显隐痛，急性发作时中上腹或右上腹绞痛，可能合并出现发热、皮肤黄染、尿黄，引起急性胆管炎。胆总管结石患者会引起急性胆源性胰腺炎，表现出中上腹或右上腹持续性剧烈疼痛，且恶心呕吐后无缓解，血淀粉酶增高。