造血干细胞移植的并发症包括：

1、预处理：大剂量化疗药物可能导致心肌供血不足、出血性膀胱炎、感染等并发症；

2、移植后：初期容易引起口腔、泌尿道和消化道感染；异基因造血干细胞移植后期容易出现口腔溃疡、皮肤改变、消化道出血、便血、腹泻、肝功能异常等并发症。