深龋洞的发病原因，主要是从四要素来阐述：口腔内细菌的作用，尤其是吃了含糖量高的食物；宿主及时间，附着在牙面上的食物残渣和细菌，也就是我们平常看到的牙齿上黑色的东西，临床当中叫做牙菌斑。牙菌斑里有一种能把牙齿腐蚀的细菌，在适宜的温度刺激下，牙菌斑生成会产酸，侵蚀牙齿，使之脱矿，并进而破坏有机质，产生龋洞。