胃肠道间质瘤的检查方法包括：

1、胃肠镜检查：通过胃肠镜了解肿瘤所在部位，如食道、胃、十二指肠肿瘤均可通过胃镜发现，部分结直肠间质瘤可通过肠镜发现；

2、胶囊内镜：小肠间质瘤可通过该检查获得相应提示；

3、CT检查：通过该检查可发现腹腔消化道占位性病变；

4、病理活检：得到相应肿瘤提示；

5、超声内镜检查：通过超声内镜了解肿瘤发生的层次；

6、术后病理和免疫组化分析。