子宫内膜异位症是良性疾病，一般不会导致患者死亡，但是会严重影响患者的生活质量。

子宫内膜异位症的病灶可以向深部组织浸润，导致患者出现严重的痛经，甚至导致子宫内膜异位到直肠，引起剧烈腹痛，甚至出现便血，从而影响患者的生活质量。此时往往需要进行手术治疗，术后再配合药物处理，防止子宫内膜异位症复发。如果病变累及直肠，则可能需要切除一段肠管。