肛瘘分类如下：

1、根据瘘管多少分为单纯性和复杂性，如果只有一个内口，一个外口，一条瘘管的叫做单纯性肛瘘，多于两个管道的称为复杂性肛瘘；

2、高位和低位之分，瘘管穿过肛管直肠环以上叫高位，穿过肛管直肠环以下叫低位，最新的分类是根据肛瘘手术后，是否引起肛门失禁为原则，引起肛门失禁的叫高位肛瘘，反之叫低位肛瘘。