高位复杂性肛瘘危害很大，具体如下：

1、主要症状为流脓、疼痛、肛门周围瘙痒，给患者带来身体不适及生活中的不便。流脓使内裤不洁，肛门疼痛、刺痒造成患者工作、生活不便；

2、炎症反复发作，造成肛门周围皮肤、肌肉僵化，肛门括约肌功能受到一定影响，时间过久肌肉弹性减弱，造成肛门狭窄，引起患者排便不畅或大便变细；

3、高位复杂性肛瘘反复发作可引起直肠阴道瘘、直肠膀胱瘘、直肠尿道瘘等并发症。