肛周脓肿在急性期发病急，疼痛剧烈，可伴有高热、局部红肿、热痛等症状。自行破溃或医源性的手术切开引流后，有形成肛瘘的可能。发现肛周脓肿后，要及时治疗，尤其在肛门两侧的坐骨直肠窝以及会阴静脉下的脓肿最为凶险，如果不及时治疗，可引起休克，甚至危及生命。肛周脓肿一旦确诊，要及早的手术，手术方式有：
1、肛周脓肿根治术：清创彻底，不易形成肛瘘，可根治，但切口较大，愈合慢；
2、肛周脓肿切开引流术：创伤较小，但开放不彻底，容易形成肛瘘。