肛周脓肿术后的愈合时间与发病类型、部位及患者的自身状况等有关，如有无糖尿病及内科疾病等均影响愈合时间。单纯的表皮下脓肿，采取小切口清创、排脓，愈合时间一般为7天；若肛周脓肿位置较深，达括约肌间隙，脓肿引流位置较高，引流不够充分，需挂线或下引流管冲洗等，愈合时间约需3周，甚至6周方能彻底治愈；复杂性的肛周脓肿并发皮下浅筋膜炎、坏死性筋膜炎等，愈合时间更长，需2-3个月方可治愈。