慢性骨髓炎的患者炎症期局部有骨质增厚或骨膜反应，包括形成窦道、脓肿、死骨。部分病人经治疗，窦道可能闭合，在抵抗力较低下时，可能再发病。慢性骨髓炎会经久不愈，且病灶反复发作。有时活动不当会出现局部破溃，经过治疗可能窦道愈合，但愈合不是完整愈合，而是表面愈合。时间久后窦道周围出现瘢痕组织，血液循环变差，血供较差。慢性骨髓炎的治疗是长期的过程。