小儿支原体肺炎只有极少部分能够自愈。如患儿确诊为支原体肺炎，建议按照支原体肺炎用药指南规范用药，可选用阿奇霉素，用药时间为2-3周。家属需注意在新生儿期小儿受到支原体感染，应立刻到医院就诊，特别是42天以内的婴儿，其身体各方面发育仍不成熟，抵抗力较差，支原体肺炎无法自愈，不建议自行喂药或不到医院就诊。