肛瘘的治疗包括中医方法和西医方法。中医方法较简单，并发症也少，分为切开方法和挂线方法。对于低位肛瘘，采用切开的方法或切除的方法，对于高位肛瘘必须挂线。中医的挂线疗法，可起治疗作用，且不会损伤肛门括约肌，导致肛门失禁。挂线分为挂实线、挂浮线、挂虚线等。所谓挂线，是在内口和外口之间挂一个丝线或橡皮筋，起到缓慢切割的作用，既能治好伤口，又能治好肛瘘，又不至于导致肛门失禁。