引起咽炎的原因较多，其中有种称为理化的气体或粉尘刺激，其中烟作为气体的不良刺激，可以引发咽炎。但并非所有患者，其咽炎均由吸烟或二手烟引起，主要存在较强的个体差异性。烟中含有尼古丁、焦油等成分，这些成分对于黏膜系统，均为不良刺激，可以引起黏膜系统上皮化，损伤黏膜下的杯状细胞或纤毛功能，从而会引发咽部黏膜病变。

咽炎属于咽部黏膜病变，所以吸烟在一定程度上，可以导致或加重咽炎。因此在治疗标准上，第一条便写的是要先禁烟、禁酒，所以抽烟对咽炎有一定的影响。若患有咽炎，尽量避免或少吸烟，以及尽量避免接触二手烟。