舌下腺导管细小或过于弯曲的人容易患有舌下腺囊肿；局部炎症破坏导管口致使唾液分泌受阻，无法及时排出，形成的唾液潴留也容易发病；导管分泌黏稠的人容易发病；分泌的唾液含钙盐成分较高的人容易形成小结石，堵塞导管同样容易发病；唾液腺分泌功能亢进的人容易发病；青少年的舌下腺分泌功能强大，分泌的唾液量大，因此也容易患有舌下腺囊肿。

舌下腺囊肿按临床表现可分为单纯型、口外型和哑铃型，舌下腺囊肿依据病因可分为外渗性和潴留性，外渗性较为多见，约占80%，是由于导管破裂唾液外漏渗于周围组织所致，由损伤引起。潴留性舌下腺囊肿较少，约占20%，患者是由于导管部分阻塞，唾液分泌潴留导致导管囊性扩张。