结肠管状腺瘤伴低级别上皮内瘤变，是轻度或中度异型增生，可归到良性肿瘤范畴。如果是高级别上皮内瘤变，为重度异型增生，需归到恶性肿瘤范畴。

若结肠管状腺瘤伴低级别上皮内瘤变已经明确为良性，并且肿瘤较小，可在内镜下进行完整切除，但需保证切缘干净。如果肿瘤较大，需通过经腹或腹腔镜下做肿瘤局部切除，也可进行节段肠管切除，切除干净后通常预后较好。