颅内出血手术的后遗症取决于出血量大小、出血部位、患者在手术前的功能状态等因素。
通常颅内出血较常见的后遗症有肢体的偏身感觉障碍、肢体偏瘫，以及不同程度的意识障碍，即昏迷。此外患者还可能会出现一过性的并发症，也可能会由于病情加重而危及患者生命，如呼吸道感染、肺炎、应激性溃疡、泌尿系感染等因素，可以和患者其他合并症同时出现。在患者长期偏瘫的基础上，还可能会出现肢体肌肉萎缩、关节僵硬，长期卧床的患者还可能会出现褥疮。
另外还会出现泌尿系感染、下肢静脉血栓，以及严重的患者还可能会发生肺栓塞，并且在短时间内有可能会直接危及生命。所以颅内出血手术后的后遗症的情况较多和复杂，如果患者颅内出血不是位于重要功能区，在术后也可能不遗留任何后遗症。
