乳房再造的后遗症包括短期和长期的后遗症，根据采用的材料不同而略有不同。对于假体的后遗症，乳房假体再造在手术后短期之内的后遗症主要包括出血、感染以及淋巴瘘的问题。长期的后遗症包括包膜挛缩、乳房假体移位等后遗症，有些后遗症可控，有些是随机发生，需要加以正确的引导和防范。

自体乳房再造的后遗症主要包括供区和受区两方面。受区在手术后的短期之内最严重的后遗症就是皮瓣坏死、乳房再造失败，而其它比较常见的并发症还包括感染、局部缺血或变硬等，这些都需要依赖于术后的良好护理。对于长期的并发症而言，自体的后遗症要比假体的后遗症明显少，自体乳房再造的供区会出现腹壁疝、腹壁瘢痕以及腹部肌力的减弱等影响，同样依赖于后期的良好护理。总体而言，假体再造术后的长期并发症较多，而自体再造长期的并发症中，如果能避免疝的问题，患者基本上可以恢复自由行动。