治疗眼外肌麻痹，首先要确定是肌肉麻痹和眼睛的位置，因为在眼外肌麻痹病种上要排除全身病，明确病因。眼外肌麻痹治疗最有效方法，目前公认的是针灸，所以只有明确病因，确定肌肉麻痹和眼睛部位，才能有目的性针灸。常用电针，就是针灸加电针刺激，促进眼睛局部恢复。
还需加眼部穴位注射，必须要确诊是哪只眼睛，在患眼上做穴位注射治疗。大部分眼外肌麻痹是因糖尿病、高血压、脑梗等全身病引起，还要为患者治疗全身病，结合全身病一起治疗，在中医眼科还要针对全身病开中药，进行中药调理。所以眼外肌麻痹最有效的综合治疗方案是针灸，穴位注射加中药进行治疗。
