造成肛门疼痛的原因非常多，有器质性改变，有常见的肛肠疾病引起的肛门疼痛，还有功能性疾病引起的肛门疼痛，以至于全身疾病引起的肛门疼痛，而且还有很多肛门疼痛并不知道它的原因，如果不知道原因的肛门疼痛，称为原发性肛门痛，或者以疼痛和部位联合命名，称为综合征的状态。常见的造成肛门疼痛的疾病如下：

1、肛裂：肛裂就是在肛门有松紧的地方，出现梭型的一个溃疡，这个溃疡跟肛门括约肌关系密切，在排便的时候会造成肛门剧烈疼痛，排便以后再次出现剧烈疼痛，也就是肛裂引起的肛门疼痛是一个周期性的，有些患者会形容这种疼痛是抽搐般疼痛，或者像心脏抽搐般疼痛，个别患者或者严重的肛裂患者疼痛时间非常长，有的时候会疼痛几个小时，甚至整个白天，影响到患者的工作、情绪等；

2、肛周脓肿：肛门周围软组织感染形成脓肿以后，疼痛初始轻微，逐渐加重，大概2-3天以后疼痛达到高峰，如果出现肛门周围脓肿，患者走路会受到限制，不敢正坐，或者走路时候会收着腿，看到这样体位的患者，先要想到是肛周脓肿引起；

3、内痔脱出：形成了血栓形成，如果内痔不能纳回肛门，会出现充血、水肿，甚至绞窄，这种情况下，通常在肛门会发现一个充血、水肿的包块，触之有疼痛，这就是所谓的一个致病急症状态。