十二指肠球部溃疡疼痛的缓解，最主要是通过临床用药，球部溃疡分为有幽门螺杆菌感染的患者、没有幽门螺杆菌感染的患者。有幽门螺杆菌感染的患者先对幽门螺杆菌进行清除，应用标准胃四联，目前常用雷贝拉唑、阿莫西林、克拉霉素、胶体果胶铋进行规范的2周用药，一般情况下对95%以上的幽门螺杆菌感染的球部溃疡患者都会有清楚的疗效。

没有幽门螺杆菌感染但是球部溃疡发作，可以通过抑制胃酸、抑制胆汁反流进行病因清除，抑酸药常用的有奥美拉唑、雷贝拉唑、兰索拉唑，抑制胆汁反流的最常用的铝碳酸镁片。球部溃疡患者还可以口服胃黏膜保护剂，常用的胶体果胶铋、索法酮干混悬剂、麦滋林、瑞巴派特，胃黏膜保护剂的摄入对球部溃疡疼痛的缓解也很有帮助。