双相情感障碍虽然有自限性，但是如果不加以治疗，复发不可避免。在没有经过治疗的患者当中，50%的患者在首次发作后的第1年会自发地缓解。但在以后的岁月里，缓解概率不到1/3，终身的复发率达90%以上。大概有15%的患者会自杀死亡，10%的患者会转归为慢性状态。

在应用碳酸锂治疗双相情感障碍以前，患者一生平均会有9次发作，而长期反复的双相情感障碍发作会导致患者人格改变和社会功能受损。