丛集性头痛的危害与其他疼痛的危害相同。丛集性头痛的疼痛可引起周期性的疼痛，且疼痛的性质既有钝痛、刺痛、也有烧灼样疼痛。其危害首先影响患者的生活质量，造成心理压力，导致患者生活质量的下降。其次会造成患者情绪、情感的障碍，产生焦虑、不安等情绪，对生活期望值下降，甚至可能与周围人产生冲突，若继续发展，可能会引起精神抑郁等疾病。