治疗慢性萎缩性胃炎的药物如下：

1、病因治疗：根据胃镜和胃镜下活组织病理检查结果明确病因，给予对因治疗。临床上常见的发病原因为幽门螺杆菌感染，应给予抗幽门螺杆菌治疗；

2、西医：包括保护胃黏膜药物、抑酸剂等，如有恶变倾向，应进行内镜下黏膜切除及黏膜下剥离术；

3、中医：包括胃复春、摩罗丹、荜铃胃痛等。

具体用药请结合临床，以医生面诊指导为准。