会厌囊肿的治疗方法主要是手术治疗，会厌囊肿、粘液囊肿较小的患者，可以在门诊局麻下进行会厌囊肿的掀盖术，彻底治疗可以在手术室全麻下用支撑喉镜，完整切除会厌囊肿，术中可结合电刀、等离子将切除会厌囊肿的创面彻底止血。术后患者咳嗽时没有出现血，则手术效果较佳，手术安全。另外患者术后反应没有痛苦，第二天嗓子不适症状便会消失。