自身免疫性肝病的鉴别诊断如下：

1、该病包含自身免疫性肝炎、原发性胆汁性胆管炎以及原发性硬化性胆管炎，其临床表现无特异性，可通过血液生化检查、免疫学检查、影像学检查进行鉴别；

2、与酒精性肝病相鉴别：长期饮酒的患者GGT、ALP、AST均可升高；

3、与非酒精性脂肪性肝病相鉴别：免疫性肝病注意与非酒精性脂肪性肝炎相鉴别；

4、与药物性肝病相鉴别：胆汁淤积性肝损伤需与原发性胆汁性胆管炎和原发性硬化性胆管炎相鉴别；

5、与Wilson病（肝豆状核变性）相鉴别：其主要生化表现为铜蓝蛋白升高等。