肛瘘手术常规使用椎管内麻醉，椎管内麻醉是将麻药注入到椎管的蛛网膜下腔或者是硬膜外腔隙，对脊神经根产生麻醉作用。椎管内麻醉分为单次腰麻和连续硬膜外麻醉。肛瘘手术通常使用0.5%的罗哌卡因2ml注入蛛网膜下腔，3-5分钟即可起效，起效时表现为双下肢麻木，没有知觉，作用时间大概为4-6个小时。手术时患者清醒，但感觉不到疼痛。