慢性结膜炎治疗通常以局部治疗为主，少数患者结合全身治疗。局部治疗根据不同病因，如细菌感染引起，一般抗细菌治疗，及抗生素眼药水治疗。如非细菌感染性引起，眼部本身疾病引起，需治疗眼部疾病后效果较好。部分患者长期使用眼药水，也可引起结膜组织的慢性改变。一旦出现症状，需将眼药水或眼药膏停掉，使用人工泪液，以促进眼表修复。