外科医生一般不推荐进行内镜下间质瘤切除。因为间质瘤来源于胃肠间质细胞，肿瘤细胞与周围肌肉、黏膜层相粘连，内镜下剥除具有一定风险，易造成胃壁出血、穿孔，甚至造成肿瘤播散，因此，内镜切除不作为常规的推荐方式。对于微小的间质瘤，即＜1cm的间质瘤，进行外科手术时难以找到病变，可以借助内镜的帮助达到治疗的目的。