胆管结石治疗需遵从中国肝胆外科元老黄志强院士提出的方针：取尽结石，消除狭窄，切除病肝，通畅引流。其中切除病肝占有特别重要位置。由于胆管结石形成使得反复炎症刺激造成胆管开口狭窄。若病肝未行切除，结石仍可复发。同时，胆管慢性炎症长期刺激，可发展为肝内胆管细胞性肝癌，此病变与结石很难区分，甚至术前CT、磁共振都无法鉴别，可能延误治疗。