肛门指检为临床有创性检查之一。肛门指检主要用于检查患者直肠下段，肛门至肠道内距离小于6-7cm的部分疾病。低位的直肠癌、肛管癌、良性肿物、直肠下段息肉、较大的痔核均可通过肛门指检发现。临床有一类疾病称之为肛瘘，对肛瘘内口检查时需采取肛门指检，部分的肛裂患者亦需采取肛门指检。肛门指检为肛肠科疾病较为重要的临床检查手段之一。