肾脏囊肿大部分属于良性囊肿，五公分以下的肾囊肿一般不需采取外科治疗，以定期复查为主。

五公分以上的单纯性肾囊肿，目前最有效的方法为腹腔镜下肾囊肿去顶减压术。即通过三个微创洞切开囊壁，充分释放囊液，以缓解囊肿对正常肾脏的压迫，从而保护肾脏功能。

对于年纪较大或有基础疾病而无法耐受手术创伤和麻醉的患者，可采取局麻肾囊肿穿刺抽液及局部硬化剂治疗。其具有创伤小、风险低的优点，但易复发并可能对肾盂集合系统产生损伤。