与CT相比磁共振检查对实质性器官、软组织、骨骼等较有优势，CT对于肺部与空腔脏器较有优势。磁共振常见疾病检查包括：

1、腰椎、中枢神经的部分结核；

2、肝、脾、肾脏的结核；

3、四肢骨骼软组织的肿胀、结核。

对于软组织检查，磁共振较CT可更易、更早期发现病变,此为磁共振相对CT的较大优势。