过敏性结膜炎可以在季节变换之前，应用肥大细胞稳定剂来进行预防；如果疾病已经发生，可以应用抗过敏药物进行治疗；严重的过敏性结膜炎可以应用糖皮质激素，激素类药物可快速缓解症状，但使用时间过长可能会引起眼压升高或产生药物依赖性。此外，特别严重的过敏性结膜炎，如春季卡他性结膜炎可应用自身免疫性药物，但存在明显的毒副作用，需在医生的指导下用药。