肛瘘在肛管或直肠内有原发性的内口，可通过病理性的管道通向肛门周围的皮肤组织，因肛管和肛门相通，所以有持续的分泌物或感染源，可导致管道内炎症或局部炎症反复发作。若单独用药物或保守治疗手段，仅可减轻局部肿胀或炎症，无法彻底治愈。对于肛瘘的治疗，若条件允许，通常建议进行手术根治。若患者患有一些基础疾病，无法及时手术，可通过药物控制局部症状，但若不进行手术治疗，肛瘘疾病无法达到自愈。