肌间静脉血栓的症状主要集中在小腿，主要表现为小腿的肿胀、疼痛，患者行走时可出现轻度疼痛，握小腿肌肉时出现肌肉疼痛的症状。

较少患者可出现呼吸困难，多提示为肺动脉栓塞。肌间静脉血栓的症状易与其他症状相混淆，应及时鉴别诊断，以免耽误治疗。

临床多建议肌间静脉血栓患者应适当休息，不可进行剧烈活动，严禁进行小腿部位的按摩，另外，严格的抗凝治疗对肌间静脉血栓尤为重要。