绝大部分蛋白尿患者有肾小球疾病，需用糖皮质激素治疗；若效果不佳，还需使用环孢素、他克莫司或吗替麦考酚酯等免疫抑制剂；若较严重可用利妥昔单抗等生物制剂治疗。蛋白尿患者治疗的疗程需根据其对药物的反应进行分析，针对肾病综合征患者，会有激素敏感、激素依赖及激素耐药等不同的表现。若患者激素耐药则预后欠佳，出现肾功能衰竭时还需进行透析治疗，而部分蛋白尿患者则对药物较为敏感，较快即可痊愈。