肛周脓肿手术后是否出现肛瘘须根据术中探查情况决定。该病感染较特殊，起源于肛门腺体感染及肛门部皮肤黏膜缺损、外伤，局部感染扩散至肛周皮肤下，甚至于直肠周围形成脓肿，需于手术中寻找脓肿来源，避免后期形成肛瘘。人体大约均有6-8个肛门腺体，术中将腺体一并治疗，后期出现肛瘘可能性较小；如果感染来源不清，只能进行引流手术，单纯将脓液排出，缓解局部红肿热痛及发热等症状，术后可能形成肛瘘。