运动后膝关节疼痛的处理方法一般取决于疼痛的位置和疼痛的持续时间，具体如下：

1、如疼痛位置位于膝关节周围，原因多为韧带和肌肉的拉伤，如疼痛位置位于膝关节内，建议及时就医进行相应的检查，排除半月板、韧带或软骨的损伤；

2、如疼痛时间相对较短，通过充足的休息可缓解，可能与运动量较大有关，建议适当减小运动量。如运动后通过充足的休息无法缓解疼痛症状，建议及时就医进行相应的检查，排除结构性损伤。