醒觉不仅仅是受神经调节，同时受到神经生化调节，在大脑调节中，有一些生物化学物质使人脑处于醒觉状态，这些物质称之为醒觉因子，主要包括乙酰胆碱和去甲肾上腺素、多巴胺等，作用于大脑皮层，使人体维持在清醒状态，保持在醒觉状态，能使大脑功能正常运转。其中，多巴胺主要维持行为醒觉。γ-氨基丁酸也参与调节，γ-氨基丁酸释放减少有利于促进醒觉，睡眠时释放增多。乙酰胆碱增多，有利于维持醒觉，尤其是大脑特别兴奋时，释放大量增加，而释放减少时，醒觉程度就会下降。